试剂解冻与混合步骤
- 从冰箱中取出试剂。
- 缓慢解冻试剂,以保持其活性。
- 轻轻颠倒试剂进行混合,尽量避免产生气泡。
- 在低速下进行离心。
注意:在混合过程中,要尽量避免气泡的产生,因为气泡可能会影响酶的活性或实验结果的准确性。
稀释步骤
1) 若需追踪模板,请按以下步骤进行稀释;
2) 若无需追踪模板,则可直接用无菌超纯水稀释cDNA,或直接使用cDNA原液。
荧光定量仪器设置
常见的荧光定量仪器通常为96孔反应盒,基本结构为12列×8行。
实例解析
以基因1为例,配制大体系的建议:
- HieffUNICON®ColorGPSqPCRMasterMix 10μL
- 根据孔数
,选择n+1或n+2作为总数(每孔18μL)进行配制。 - 正向引物(10μM) 0.4μL
- 反向引物(10μM) 0.4μL
- 无RNA酶H2O 7.2μL
以上各组分配置完毕后,应紧闭管盖,并轻弹管壁以确保充分混匀,随后进行短暂的离心(1-2秒),再轻弹管壁以防止气泡产生,然后进行瞬间离心,确保所有溶液都沉到管底。
注意事项
若使用显踪剂,建议模板投入体积控制在2-5μL,以保证显踪效果;对于cDNA母液,建议控制在2μL(反应体系的1/10)以内,以避免影响扩增效果。
上样体系的配置
基因1检测组分单孔量配置
- 配置大体系Mix,总量为18μL
- 加入cDNA模板 2μL
完成加样后,确保管盖紧闭,轻弹管壁混匀后,放入小型离心机进行短暂离心1-2秒,轻弹管壁后再次瞬间离心,确保无气泡后置于洁净的96孔PCR管架上。
管子检查与程序设置
在上机前,仔细检查管子,保证管盖及管身无任何标记,管内无气泡、管壁无液体残留。若采用常规程序,请进行如下设置:
- 循环步骤
- 温度
- 时间
- 循环次数
预变性 95℃ 2分钟 1次; 变性 95℃ 10秒 40次; 退火/延伸 60℃(根据引物TM值和目的基因的长度)30秒;熔解曲线阶段依据仪器默认设置。
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